A igreja da Lapa pertence à Irmandade de N.ª Sr.ª da Lapa, instituída na cidade em meados do século XVIII, pelo padre brasileiro Ângelo Sequeira. Lançada a primeira pedra em 1756, a construção da igreja arrastou-se por mais de 100 anos devido à escassez de recursos e instabilidade política que marcou a cidade e o século XIX. De estilo neoclássico e rococó, um dos seus Arquitetos foi José de Figueiredo Seixas. As torres sineiras não se ergueram senão na segunda metade do séc. XIX, segundo traço do Arq.º José Luís Nogueira Jr. Já no séc. XX, o Arq.º Marques da Silva foi autor do edifício contíguo à Igreja, a Casa da Irmandade.

Desde 1835, a Igreja acolhe o coração de D. Pedro IV doado, pelo próprio, à cidade do Porto como forma de reconhecimento da sua vitória contra seu irmão – Cerco do Porto (1832-1833). Encontra-se depositado num mausoléu com 7m de altura, do lado esquerdo na capela-mor. Aberto para cerimónias ou efeitos de preservação, as suas 5 chaves encontram-se no gabinete do Presidente da Câmara da cidade do Porto. Este monumento tem o símbolo da bandeira real portuguesa e da bandeira brasileira, assim como inscrições em latim onde se destaca a bravura do rei. Durante várias décadas, a celebração das exéquias anuais por D. Pedro IV não deixou que se perdesse a memória dos valores cívicos simbolizados pelo herói do Cerco do Porto.